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Microbiologie Environnementale - MIC

Thèmes de recherche :

L’équipe de Microbiologie Environnementale (MIC) s’intéresse aux interactions entre microorganismes du milieu hydrique et avec leur environnement. Les recherches menées prennent en compte la biodiversité (bactéries, virus), la distribution spatio-temporelle (microorganismes planctoniques, agrégés et organisés en biofilm) et les activités biologiques (croissance, survie, transferts de gènes, biotransformation) de ces systèmes. Dans ce contexte, nous cherchons à comprendre (i) la dissémination et la persistance de virus (virus entériques pathogènes et bactériophages fécaux) ou d’éléments génétiques mobiles (vecteurs d’antibiorésistance) d’origine anthropique dans l’environnement et (ii) les phénomènes de formation des biofilms et leur réactivité avec des composés inorganiques (oxydes de fer). Ces différentes actions portent sur plusieurs enjeux sociétaux comme la résistance des bactéries aux antibiotiques, le risque infectieux lié à l’environnement et aux aliments, les traitements et la distribution des eaux, la réutilisation des eaux usées, la biodétérioration des matériaux, les biosalissures des dispositifs industriels.


Mots clés : eau - biofilms - éléments génétiques mobiles - virus - phages - adhésion/agrégation - propriétés des biointerfaces - survie - biocorrosion - réponse aux stress - transfert de gènes d’antibiorésistance 

Animateur : Christophe Gantzer, Professeur

Composition de l’équipe :

Permanents :    
Sandrine BANAS (MC)
Xavier BELLANGER (MC)
Isabelle BERTRAND (MC)
Jean-Claude BLOCK (PREM)
Joël COULON (MC)
Christophe GANTZER (PR)
Hélène GUILLOTEAU (IE UL)
Hélène JEULIN (MCUPH)
 

Frédéric JORAND (PR)
Sylvie KAUTZ (T EPHE)
Sandrine LEMOINE (AdjA UL)
Laurence MATHIEU (MC EPHE)
Christophe MERLIN (MC)
David SANTILI (ATRF UL)
Evelyne SCHVOERER (PUPH)


Non-Permanents :
   

Julie CHALLANT(AI CDD)
Manon CHASSAING
(Thèse)
Magali DE LA CRUZ BARRON (Thèse)
Laura DIDIERJEAN0,5 (Thèse)
Honorine FENAUX0,5 (Thèse)

Anaïs KERAVAL (IE CDD)
Alice LEDUC (Post-Doc)

 

Pauline LOISON (Post-Doc)
Audrey MARTIN-MERIADEC (AI CDD)
Aline PERRIN (Thèse)
Véronica ROMAN (Thèse)
Maryse Iris SEDJI (Thèse)



 

Environmental Microbiology - MIC

Research Theme :

The team of “Environmental Microbiology” (MIC team) focuses its research activity on the interaction between hydric microorganisms and their environment. The investigations carried out take into account the biodiversity (bacteria, viruses), the spatio-temporal distribution (planktonic, aggregated or biofilm-organized microorganisms) and the biological activities (growth, survival, horizontal gene transfer, biotransformation) of these systems. In this context, we try to understand (i) the dissemination and persistence of viruses (pathogenic enteric viruses and fecal bacteriophages) and mobile genetic elements (vector of antibiotic resistance genes) of anthropogenic origins once released in the environment, and (ii) the biofilm formation phenomena as well as their reactivity with inorganic compounds (iron oxides). These various research activities address several societal issues such as the bacterial resistance to antibiotics, the infectious risk related to the environment and food, the treatment and distribution of water, the reuse of wastewater, the biodeterioration of materials, and the biofouling of industrial devices.


Key words : water - biofilms – mobile genetic elements - virus - phages - adhesion/aggregation – biointerface properties - survival - biocorrosion - stress response – antibiotic gene transfert

Team’s coordinator : Christophe Gantzer, Professeur

Composition of the team :

Permanent staff :
Sandrine BANAS (Lecturer)
Xavier BELLANGER (
Lecturer)
Isabelle BERTRAND (
Lecturer)
Jean-Claude BLOCK (
Professor emeritus)
Joël COULON (
Lecturer)
Christophe GANTZER (
Professor)
Hélène GUILLOTEAU (Engineer UL)
Hélène JEULIN (
Lecturer)
 

Frédéric JORAND (Professor)
Sylvie KAUTZ (
Tech. EPHE)
Sandrine LEMOINE (
Assist. Tech. UL)
Laurence MATHIEU (
Lecturer EPHE)
Christophe MERLIN (
Lecturer)
David SANTILI (
Assist. Tech. UL)
Evelyne SCHVOERER (
Professor)


Non-Permanent staff :
   

Julie CHALLANT(Assist. Engineer contract.)
Manon CHASSAING
(PhD)
Magali DE LA CRUZ BARRON (
PhD)
Honorine FENAUX0,5 (
PhD)
Anaïs KERAVAL (Engineer contract.)
Alice LEDUC (Post-Doc)

 

Pauline LOISON (Post-Doc)
Audrey MARTIN-MERIADEC (
Assist. Engineer contract.)
Aline PERRIN (
PhD)
Véronica ROMAN (
PhD)
Maryse Iris SEDJI (
PhD)