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MERLIN Christophe

Maître de Conférences (HDR) - Université de Lorraine
Contact : christophe.merlin@univ-lorraine.fr

 

 

Recherches actuelles
Transfert de gènes dans des matrices environnementales naturelles : transfert de gènes de résistance aux antibiotiques, transfert de plasmides, facteurs environnementaux affectant le transfert de plasmides. Effets des antibiotiques en concentrations sub-inhibitrices.

Toxicité de nanoparticules de type Quantum Dots sur le système bactérien (en collaboration avec Prof. Raphael Schneider) : identification de dommages cellulaires, biotransformation des nanoparticules, désinfection, réponse bactérienne au stress.

Agrégats biologiques : adhésion, activités physiologiques en biofilms, dynamique du système bactérien en biofilms.

Parcours
1996 : Doctorat de l’Université de Grenoble, France (Génétique microbienne)
1997-1998 : Post-doctorat à « Michigan State University », USA (Ecologie microbienne)
2000-2003 : Post-doctorat à « University of Edinburgh », UK (Génomique bactérienne)
2003-2004 : Post-doctorat au CEA de Cadarache, France (Transcriptomique bactérienne)
depuis 2005 : Maître de Conférences à l’ Université de Lorraine (Microbiologie environnementale)

Domaines de compétences
Microbiologie
Microbiologie environnementale
Biologie moléculaire
Génétique bactérienne

Enseignement/encadrement
Bases de microbiologie, Microbiologie environnementale, Identification bactérienne, Biofilms bactériens et génétique des biofilms, Transfert de gènes et éléments génétiques mobiles, Communication bactérienne et interactions cellules-cellules, Biosenseurs microbiens, Biologie moléculaire et outils moléculaires.

Responsabilités administratives
- Responsable de l’antenne « Pôle de l’eau » du LCPME
- Responsable de l’axe "Efficacité des Installations de Traitement" de la Zone Atelier Moselle (http://zam.univ-lorraine.fr/)
- Membre du CSHS du LCPME (représentant de l’Administration)
- Vice-leader d’un groupe de travail dans l’action COST NEREUS (http://www.nereus-cost.eu/)

Bibliographie

Productions significatives
« Scornec H, Bellanger X, Guilloteau H, Groshenry G, Merlin C. (2017) Inducibility of Tn916 conjugative transfer in Enterococcus faecalis by subinhibitory concentrations of ribosome-targeting antibiotics. J Antimicrob Chemother. 72(10):2722–2728 »

« Berendonk TU, Manaia CM, Merlin C, Fatta-Kassinos D, Cytryn E, Walsh F, Bürgmann H, Sørum H, Norström M, Pons MN, Kreuzinger N, Huovinen P, Stefani S, Schwartz T, Kisand V, Baquero F, Martinez JL. (2015) Tackling antibiotic resistance : the environmental framework. Nat Rev Microbiol. 13:310-317 »

« Bellanger X, Guilloteau H, Bonot S, Merlin C. (2014) Demonstrating plasmid-based horizontal gene transfer in complex environmental matrices : A practical approach for a critical review. Sci Total Environ. 493:872-882. »

« Persistence and dissemination of the multiple-antibiotic-resistance plasmid pB10 in the microbial communities of wastewater sludge microcosms », Merlin C., Bonot S., Courtois S. and Block J.-C., Water Research, 45 (2011), 2897-2905

« Monitoring the dissemination of the broad-host-range plasmid pB10 in sediment microcosms by quantitative PCR », Merlin C. and Bonot S., Appl. Environ. Microbiol., 76 (2010), 378-382

« The exposure of bacteria to CdTe-core quantum dots : the importance of surface chemistry on cytotoxicity », Schneider R., Wolpert C., Guilloteau H., Balan L., Lambert J. and Merlin C., Nanotechnology, 20(22) (2009), :225101

« Why is carbonic anhydrase essential to Escherichia coli ? », Merlin C., Masters M., McAteer S. and Coulson A.., J. Bacteriol., 185(21) (2003), 6415-6424

« Mobile elements as a combination of functional modules », Toussaint A. and Merlin C., Plasmid., 47(1) (2002), 26-35

C.MERLIN publications (2017) - 472 ko